AAp-MSMD
Amino Acid Preference Mapping using Mixed-Solvent MD
各種アミノ酸をプローブとした共溶媒分子動力学 (MSMD) シミュレーションを用いて、 タンパク質上のペプチド結合部位の予測、およびペプチドの1残基置換による結合親和性の変化を推定する手法です。
本手法は、タンパク質間相互作用 (PPI) やタンパク質-ペプチド結合の推定に応用でき、 新しい創薬モダリティに役立つことが期待されます。
Amino Acid Preference Mapping
各種アミノ酸をプローブとした共溶媒分子動力学 (MSMD) シミュレーションを用いて、 タンパク質上のペプチド結合部位の予測、およびペプチドの1残基置換による結合親和性の変化を推定する手法です。
本手法は、タンパク質間相互作用 (PPI) やタンパク質-ペプチド結合の推定に応用でき、 新しい創薬モダリティに役立つことが期待されます。